MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Desulfosporosinus acidiphilus SJ4 plasmid pDESACI.02

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018067	ATG	2	6	283	288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	391738066
2	NC_018067	GAA	2	6	298	303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	391738066
3	NC_018067	A	7	7	308	314	100 %	0 %	0 %	0 %	391738066
4	NC_018067	AG	3	6	378	383	50 %	0 %	50 %	0 %	391738066
5	NC_018067	GGC	2	6	389	394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	391738066
6	NC_018067	AT	3	6	510	515	50 %	50 %	0 %	0 %	391738066
7	NC_018067	GAA	2	6	550	555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	391738066
8	NC_018067	CAA	2	6	1146	1151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	391738068
9	NC_018067	CTT	2	6	1206	1211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738068
10	NC_018067	ATAAA	2	10	1258	1267	80 %	20 %	0 %	0 %	391738068
11	NC_018067	GTT	2	6	1275	1280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738068
12	NC_018067	A	7	7	1333	1339	100 %	0 %	0 %	0 %	391738068
13	NC_018067	CT	3	6	2221	2226	0 %	50 %	0 %	50 %	391738069
14	NC_018067	T	7	7	2234	2240	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
15	NC_018067	TTA	2	6	2267	2272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	391738069
16	NC_018067	CTT	2	6	2433	2438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
17	NC_018067	GCTT	2	8	2515	2522	0 %	50 %	25 %	25 %	391738069
18	NC_018067	AATC	2	8	2529	2536	50 %	25 %	0 %	25 %	391738069
19	NC_018067	T	6	6	2559	2564	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
20	NC_018067	ACT	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	391738069
21	NC_018067	TC	3	6	2607	2612	0 %	50 %	0 %	50 %	391738069
22	NC_018067	CTT	2	6	2702	2707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
23	NC_018067	CCTGG	2	10	2727	2736	0 %	20 %	40 %	40 %	391738069
24	NC_018067	GTT	3	9	2777	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738069
25	NC_018067	GT	3	6	2846	2851	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
26	NC_018067	TTC	2	6	2852	2857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
27	NC_018067	TCCG	2	8	2907	2914	0 %	25 %	25 %	50 %	391738069
28	NC_018067	TCA	2	6	2935	2940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	391738069
29	NC_018067	GTT	2	6	2959	2964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	391738069
30	NC_018067	CGG	2	6	2985	2990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	391738069
31	NC_018067	GGTT	2	8	2991	2998	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
32	NC_018067	TATT	2	8	3026	3033	25 %	75 %	0 %	0 %	391738069
33	NC_018067	CTT	2	6	3044	3049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
34	NC_018067	TCT	2	6	3052	3057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	391738069
35	NC_018067	TTGG	2	8	3071	3078	0 %	50 %	50 %	0 %	391738069
36	NC_018067	GCTT	2	8	3095	3102	0 %	50 %	25 %	25 %	391738069
37	NC_018067	ATGT	2	8	3105	3112	25 %	50 %	25 %	0 %	391738069
38	NC_018067	TGG	2	6	3467	3472	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	391738069
39	NC_018067	CATGA	2	10	3477	3486	40 %	20 %	20 %	20 %	391738069
40	NC_018067	GGT	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	391738069
41	NC_018067	CTG	2	6	3585	3590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	391738069
42	NC_018067	T	6	6	3797	3802	0 %	100 %	0 %	0 %	391738069
43	NC_018067	CCT	2	6	3841	3846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	391738069
44	NC_018067	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	391738069
45	NC_018067	GATA	2	8	3875	3882	50 %	25 %	25 %	0 %	391738069

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.